In het systeem van Vertogas is het mogelijk om certificaten voor biogas te krijgen dat niet op het openbare net is ingevoed. Het biogas kan bijvoorbeeld ter plekke, of elders via een speciale pijpleiding nuttig gebruikt worden. Daarmee wordt fossiel gasgebruik verdrongen c.q. vermeden. Dit kan soms een goedkopere en efficiëntere manier van omgaan met energie, omdat hierdoor de opwerking van het gas naar netwerkkwaliteit wordt vermeden. Bij de lokale aanwending van het gas worden voor wat betreft de voorwaarden voor certificaatverstrekking gelijksoortige voorwaarden gehanteerd als bij de nuttige toepassing van warmte in de regeling voor garanties van oorsprong voor hernieuwbare elektriciteit.
Dit biedt de mogelijkheid om de groenwaarde van het gas op zo goed mogelijke wijze te benutten; dit wordt door Vertogas ondersteund. Het kan hierbij ook gaan om het comprimeren van gas tot CNG of LNG, dat per tankwagen kan worden vervoerd.